Covid : un nouveau variant "à surveiller" détecté en région parisienne

31/03/2021 Par Marielle Ammouche
Infectiologie
Après le variant breton, une nouvelle souche classée parmi les "variants d’intérêt" a été identifiée en France.  Elle a été détectée cette fois en région parisienne à l’hôpital Henri Mondor de Créteil (94), d’où sa dénomination de variant HMN.19B.

  Ce qui la rend inquiétante est le nombre important de mutations, 18, dont 7 ou 8 concerne la protéine S (Spike) du virus, ce qui pourrait avoir un impact sur la transmissibilité et l’immunité du virus. Les auteurs relèvent en particulier celles en position 501 (N501Y) et 452 (L452R) qui améliorent l'interaction de la protéine Spike avec le récepteur ACE-2, ce qui pourrait permettre une meilleure transmissibilité de ce variant. Les mutations 452 et 655 (H655Y) seraient par ailleurs susceptibles de réduire la sensibilité du virus à l'effet de la vaccination anti-Covid. Des travaux sont en cours à l'hôpital Henri-Mondor sur l'éventuelle capacité de résistance au vaccin de ce variant, et pour déterminer s'il faut réellement des concentrations plus élevées d'anticorps pour le neutraliser. Ce sont les professeurs Jean-Michel Pawlotsky, Slim Fourati et Christophe Rodriguez qui ont décrit ce variant dans une lettre publiée par la revue Emerging Infectious Deseases. Il a été identifié au départ chez quatre personnes ayant eu une forme légère de Covid-19, sans hospitalisation. La souche s’est ensuite répandue en Ile-de-France, dans l'Ouest, le sud-est et le sud-ouest du pays. Dans l'enquête Flash 4 du 2 mars 2021, il représentait 1,8% des souches séquencées sur le territoire national.

En dessous des "variants préoccupants" comme les variants anglais, sud-africain ou brésilien, qui aggravent l'épidémie et la rendent plus difficile à contrôler, se situent les "variants d'intérêt" ou "variants à suivre", dont les caractéristiques génétiques potentiellement problématiques justifient une surveillance. Le variant d'Henri-Mondor, dénommé "19B/501Y (lignage A.27), est classé en variant à suivre (VOI)", précise Santé publique France. Son potentiel épidémiologique (progression ou régression face aux autres variants) est surveillé de près.   

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